Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
VAMP8Q9BV40 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms