Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms