Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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