Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGIP1Q9BQI5 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms