Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms