Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms