Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP3Q96P20 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms