Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms