Protein–RNA interactions for Protein: Q96L14

CEP170P1, Cep170-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170P1Q96L14 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP170P1Q96L14 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms