Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COG3Q96JB2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms