Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms