Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms