Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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ZNF548Q8NEK5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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