Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZA3

H1FOO, Histone H1oo, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1FOOQ8IZA3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H1FOOQ8IZA3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms