Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX29P2Q8IUI4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms