Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms