Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT9Q86SS6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms