Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC129Q6ZRS4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms