Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms