Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC137Q6PK04 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms