Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZCCHC12Q6PEW1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZCCHC12Q6PEW1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms