Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms