Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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FAM78BQ5VT40 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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