Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGD3Q5JSP0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms