Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms