Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms