Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms