Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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