Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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