Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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