Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF2Q15853 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF2Q15853 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
USF2Q15853 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
USF2Q15853 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
USF2Q15853 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
USF2Q15853 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
USF2Q15853 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
USF2Q15853 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
USF2Q15853 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
USF2Q15853 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
USF2Q15853 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
USF2Q15853 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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