Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms