Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRS1Q15050 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RRS1Q15050 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRS1Q15050 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RRS1Q15050 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRS1Q15050 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRS1Q15050 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRS1Q15050 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRS1Q15050 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRS1Q15050 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRS1Q15050 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRS1Q15050 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRS1Q15050 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRS1Q15050 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRS1Q15050 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRS1Q15050 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RRS1Q15050 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RRS1Q15050 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RRS1Q15050 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RRS1Q15050 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RRS1Q15050 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRS1Q15050 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
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