Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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COL9A2Q14055 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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COL9A2Q14055 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A2Q14055 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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