Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LAMB3Q13751 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms