Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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NAE1Q13564 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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NAE1Q13564 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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NAE1Q13564 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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NAE1Q13564 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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