Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCIRG1Q13488 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
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