Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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