Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIAQ12857 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms