Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms