Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms