Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CD164Q04900 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
CD164Q04900 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
CD164Q04900 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
CD164Q04900 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
CD164Q04900 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
CD164Q04900 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
CD164Q04900 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
CD164Q04900 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
CD164Q04900 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
CD164Q04900 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
CD164Q04900 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
CD164Q04900 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CD164Q04900 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
CD164Q04900 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CD164Q04900 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CD164Q04900 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms