Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CYP4A11Q02928 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms