Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHDQ02161 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHDQ02161 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHDQ02161 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHDQ02161 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHDQ02161 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHDQ02161 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHDQ02161 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHDQ02161 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHDQ02161 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHDQ02161 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHDQ02161 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHDQ02161 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHDQ02161 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHDQ02161 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHDQ02161 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHDQ02161 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHDQ02161 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHDQ02161 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHDQ02161 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RHDQ02161 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHDQ02161 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHDQ02161 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RHDQ02161 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHDQ02161 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHDQ02161 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHDQ02161 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHDQ02161 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHDQ02161 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHDQ02161 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHDQ02161 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHDQ02161 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHDQ02161 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHDQ02161 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHDQ02161 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHDQ02161 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHDQ02161 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHDQ02161 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHDQ02161 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHDQ02161 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHDQ02161 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHDQ02161 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms