Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIBQ01892 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPIBQ01892 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms