Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms