Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS28P62857 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS28P62857 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS28P62857 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS28P62857 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS28P62857 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS28P62857 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS28P62857 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS28P62857 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS28P62857 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS28P62857 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS28P62857 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS28P62857 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS28P62857 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS28P62857 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS28P62857 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS28P62857 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS28P62857 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS28P62857 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS28P62857 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS28P62857 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS28P62857 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS28P62857 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RPS28P62857 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RPS28P62857 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RPS28P62857 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RPS28P62857 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RPS28P62857 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RPS28P62857 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RPS28P62857 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RPS28P62857 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RPS28P62857 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RPS28P62857 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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