Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms