Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHBDL3P58872 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms