Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBASH3AP57075 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms